生专业不同从事教学任务，比如针师学科的博士负责教授针师这个学科的学生“经脉孔穴”及用针、行针之法；按摩师学科的博士教授学生“以消息导引之法除人八疾”，分别是风、寒、暑、湿、饥、饱、劳、逸；咒禁师学科的博士则教授咒禁生“以咒禁祓除邪魅之为厉者”。

此外，太医署里还有药园师，相当于今天的药剂师。从十六到二十岁的庶人中选拔出药园生到太医署学习，药园生毕业时，需熟练掌握各种药物的阴阳配伍、相生相克、有毒无毒以及采药部位、制药方法、储藏环境等技能。成为太医署的药园师之后，每年要按照节令和气候及时种植、采收药材。

太医署的医学生，学籍最长保留九年，九年之后尚未毕业的，